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重慶巴南二甲醫(yī)院排行榜排名靠前的醫(yī)院有陸軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院、重慶市婦幼保健院、重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院、陸軍軍醫(yī)大學(xué)第二附屬醫(yī)院、重慶市公共衛(wèi)生醫(yī)療救治中心,榜單醫(yī)院是博禾醫(yī)院庫基于復(fù)旦醫(yī)院排行榜、省市衛(wèi)健委、衛(wèi)生部以及醫(yī)院等級評級和當(dāng)?shù)赜绊懥C合產(chǎn)生。其中陸軍軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院是全國病理科醫(yī)院排行榜第5位、重慶市婦幼保健院是全國生殖醫(yī)學(xué)科醫(yī)院排行榜第7位、重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院是全國小兒外科醫(yī)院排行榜第3位、陸軍軍醫(yī)大學(xué)第二附屬醫(yī)院是全國血液學(xué)醫(yī)院排行榜第9位、重慶市公共衛(wèi)生醫(yī)療救治中心是西南區(qū)變態(tài)反應(yīng)科醫(yī)院排行榜第2位。

全國病理科醫(yī)院排行榜第5名:西南醫(yī)院坐落于兩江環(huán)抱、山水相依的重慶市沙坪壩區(qū)高灘巖上，有著悠久的歷史和光榮的傳統(tǒng)。醫(yī)院前身系國民政府中央醫(yī)院，1929年建于南京，1950年正式命名，現(xiàn)為第三軍醫(yī)大學(xué)第一附屬醫(yī)院、西南臨床醫(yī)學(xué)院。

全國生殖醫(yī)學(xué)科醫(yī)院排行榜第7名:重慶市婦幼保健院（重慶醫(yī)科大學(xué)附屬婦女兒童醫(yī)院 、重慶市婦產(chǎn)科醫(yī)院、重慶市遺傳與生殖研究所）創(chuàng)建于1944年，是一所集臨床醫(yī)療、婦幼保健、科研教學(xué)為一體的三級甲等婦幼保健院。

全國小兒外科醫(yī)院排行榜第3名:重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院于1956年由上海醫(yī)學(xué)院兒科系遷渝創(chuàng)建，是集醫(yī)教研為一體的國家三級甲等綜合性兒童醫(yī)院，最早被國家授予兒科學(xué)碩士、博士后流動(dòng)站，在全國最佳醫(yī)院排行榜中位居全國兒童醫(yī)院第三位。

全國血液學(xué)醫(yī)院排行榜第9名:新橋醫(yī)院是陸軍軍醫(yī)大學(xué)第二附屬醫(yī)院，建于1944年，前身是國民黨軍政部陸軍醫(yī)院，現(xiàn)已建設(shè)發(fā)展成為一所設(shè)備先進(jìn)、學(xué)科齊全、技術(shù)力量雄厚，集醫(yī)療、教學(xué)、科研、預(yù)防、保健等于一體的大型綜合性現(xiàn)代化教學(xué)醫(yī)院。

西南區(qū)變態(tài)反應(yīng)科醫(yī)院排行榜第2名:重慶市公共衛(wèi)生醫(yī)療救治中心于2008年由原重慶市胸科醫(yī)院與原重慶市傳染病醫(yī)院合并成立，歷經(jīng)70余年的建設(shè)和發(fā)展，已成為重慶市唯一一所集“醫(yī)、教、研、防”為一體的三級傳染病?？漆t(yī)院。